O exame anatomopatológico avalia peças retiradas por cirugias, que podem ser simples ou complexas. Ele se inicia pela análise a olho nu (macroscopia), onde serão selecionados os fragmentos que irão transformar-se em lâminas. Esta análise é orientada por protocolos internacionais de descrição e processamento.
As peças mais frequentes incluem apendicectomias, colecistectomias, colectomias, quadrantectomias e mastectomias, tireoidectomias, nefrectomias, entre outras.